РОЛЬ МІКРОРНК ЯК БІОМАРКЕРІВ СПАДКОВИХ ЗАХВОРЮВАНЬ
Ключові слова:
мікроРНК, біомаркери, нейродегенеративні захворюванняАнотація
Численні мікроРНК беруть активну участь у розвитку багатьох тканин та органів і можуть виконувати важливі функції при певних спадкових захворюваннях. Вивчалася роль мікроРНК при деяких захворюваннях (хвороба Гентингтона, синдром Пендреда, м’язові дистрофії, синдром Дауна, кератоконус). Очевидно, що функції нових мікроРНК у метилуванні та експресії різних генів, взаємодії РНК-РНК характеризують відставання в психічному та фізичному розвитку і можуть слугувати новими біомаркерами у ранній діагностиці хвороб спадкового генезу.
Посилання
Кайдашев И. П. Перспективы изучения и применения микроРНК в иммунологии и аллергологии / И. П. Кайдашев // Клиническая иммунология. Аллергология. Инфектология. – 2008. – № 7/8 (18/19).
Кленов М. С. Формирование гетерохроматина: роль коротких РНК и метилирования ДНК / М. С. Кленов, В. А. Гвоздев // Биохимия. – 2005. – Т. 70, вып. 11. – С. 1445–1458.
Кучер А. Н. Роль микроРНК, генов их биогенеза и функционирования в развитии патологических состояний у человека / А. Н. Кучер, Н. П. Бабушкина // Медицинская генетика. – 2011. – № 1. – С. 3–13.
МикроРНК, эволюция и рак / Н. Н. Колесников, С. Е. Титов, Ю. А. Веряскина [и др.] // Цитология. – 2013. – Т. 55, № 3. – С. 159–164.
Наследственные синдромы и медико-генетическое консультирование. Атлас-справочник / С. И. Козлова, Н. С. Демикова, Е. Семанова, О. Е. Блинникова. – 2-е изд., перераб. и доп. – М. : Практика, 1996. – 392 с.
Пішак В. П. Спадкові синдроми з основами фенотипової діагностики / В. П. Пішак, В. Ф. Мислицький, С. С. Ткачук. – Чернівці : Медуніверситет, 2010. – 608 с.
Animal MicroRNAs confer robustness to gene expression and have a significant impact on 3’UTR evolution / A. Stark, J. Brennecke, N. Bushati [et al.] // Cell. – 2005. – Vol. 123. – P. 1133–1146. doi:10.1016/j.cell.2005.11.023.
Bartel D. P. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function / D. P. Bartel // Cell. – 2004. – Vol. 116. – P. 281–297. doi: http://dx.doi.org/10.1016/S0092-8674(04)00045-5.
Bartel D. R. MicroRNAs: target recognition and regulatory functions / D. R. Bartel // Cell. – 2009. – Vol. 136, N 2. – P. 215–233. doi: 10.1016/j.cell.2009.01.002.
Baskerville S. Microarray profiling of microRNAs reveals frequent coexpression with neighboring miRNAs and host genes / S. Baskerville, D. P. Bartel // RNA. – 2005. – Vol. 11, N 3. – P. 241–247. doi:10.1261/rna.7240905.
Castillo P. E. Long-term synaptic plasticity at inhibitory synapses / P. E. Castillo, Q. C. Chiu, R. C. Carroll // Curr. Opin. Neurobiol. – 2011. – Vol. 21, N 2. – P. 328–338. doi: 10.1016/j.conb.2011.01.006
Chromosome 21-derived microRNAs provide an etiological basis for aberrant protein expression in human Down syndrome brains / D. E. Kuhn, G. J. Nuovo, A. V. Terry [et al.] // J. Biol. Chem. – 2010. – Vol. 285, N 2. – P. 1529–1543. doi: 10.1074/jbc.M109.033407.
Combinatorial microRNA target predictions / A. Krek, D. Grun, M. N. Poy [et al.] // Nat. Genet. – 2005. – Vol. 37, N 5. – P. 495–500. doi:10.1038/ng1536.
Common micro-RNA signature in skeletal muscle damage and regeneration induced by Duchenne muscular dystrophy and acute ischemia / S. Greco, M. De Simone, C. Colussi [et al.] // FASEB J. – 2009. – Vol. 23, N 10. – P. 3335–3346. doi: 10.1096/fj.08-128579.
Down syndrome: searching for the genetic culprits / E. Lana-Elola, S. D. Watson-Scales, E. M. Fisher, V. L. Tybulewicz // Dis Model Mech. – 2011. – Vol. 4, N 5. – P. 586–595. doi: 10.1242/dmm.008078.
Fabian M. R. The mechanics of miRNA-mediated gene silencing: a look under the hood of miRISC / M. R. Fabian, N. Sonenberg // Nat. Struct. Mol. Biol. – 2012. – Vol. 19, N 6. – P. 586–593. doi: 10.1038/nsmb.2296.
Grosshans H. Molecular biology: the expanding world of small RNAs / H. Grosshans, W. Filipowicz // Nature. – 2008. – Vol. 451 (7177). – P. 414–416. doi: 10.1038/451414a.
Human microRNA-155 on chromosome 21 differentially interacts with its polymorphic target in the AGTR1 3’ untranslated region: a mechanism for functional single-nucleotide polymorphisms related to phenotypes / P. Sethupathy, C. Borel, M. Gagnebin [et al.] // Am. J. Hum. Genet. – 2007. – Vol. 81, N 2. – P. 405–413.
Identification of mammalian microRNA host genes and transcription units / A. Rodriguez, S. Griffiths-Jones, J. L. Ashurst, A. Bradley // Genome Res. – 2004. – Vol. 14. – P. 1902–1910. doi:10.1101/gr.2722704.
Identification of novel argonaute-associated proteins / G. Meister, M. Landthaler, L. Peters [et al.] // Curr. Biol. – 2005. – Vol. 15, N 23. – P. 2149–2155.
Jaskiewicz L. Role of Dicer in posttranscriptional RNA silencing / L. Jaskiewicz, W. Filipowicz // Curr. Top. Microbiol. Immunol. – 2008. – Vol. 320. – P. 77–97.
Kaur P. Micro RNAs in neurotoxicity / P. Kaur, A. Armugam, K. Jeyaseelan // J. of Toxicology. – 2012. – Article ID 870150, 15 pages. Published online 2012 Mar 6. doi: 10.1155/2012/870150.
Kim V. N. Biogenesis of small RNAs in animals / V. N. Kim, J. Han, M. C. Siomi // Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. – 2009. – Vol. 10, N 2. – P. 126–139. doi: 10.1038/nrm2632.
Lee R. S. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14 / R. C. Lee, R. L. Feinbaum, V. Ambros // Cell. – 1993. – Vol. 75, N 5. – P. 843–854.
Lewis B. P. Conserved seed pairing, often flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are micro-RNA targets / B. P. Lewis, C. B. Burge, D. P. Bartel // Cell. – 2005. – Vol. 120, N 1. – P. 15–20. doi: 10.1016/j.cell.2004.12.035.
Mammalian microRNAs predominantly act to decrease target mRNA levels / H. Guo, N. T. Ingolia, J. S. Weissman, D. P. Bartel // Nature. – 2010. – Vol. 466 (7308). – P. 835–840. doi: 10.1038/nature09267.
MicroRNA-373 induces expression of genes with complementary promoter sequences / R. F. Place, L. C. Li, D. Pookot [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci USA. – 2008. – Vol. 105, N 5. – P. 1608–1613. doi: 10.1073/pnas.0707594105.
MicroRNAs control de novo DNA methylation through regulation of transcriptional repressors in mouse embryonic stem cells / L. Sinkkonen, T. Hugenschmidt, P. Berninger [et al.] // Nat. Struct. Mol. Biol. – 2008. – Vol. 15, N 3. – P. 259–267. doi: 10.1038/nsmb.1391. Epub 2008 Mar 2.
miR-125b-2 is a potential oncomiR on human chromosome 21 in megakaryoblastic leukemia / J.-H. Klusmann, Z. Li, K. Böhmer [et al.] // Genes. Dev. – 2010. – Vol. 24, N 5. – P. 478–490. doi: 10.1101/gad.1856210.
miRBase: tools for microRNA genomics / S. Griffiths-Jones, H. K. Saini, S. van Dongen, A. J. Enright // Nucleic Acids Res. – 2008. – Vol. 36. – Suppl 1. – P. 154–158.
miRNAMap: genomic maps of microRNA genes and their target genes in mammalian genomes / P. W. C. Hsu, H. D. Huang, S. D. Hsu [et al.] // Nucleic acids res. – 2006. – Vol. 34. – Suppl 1. – P. 135–139. doi: https://doi.org/10.1093/nar/gkj135.
Misha P. J. MicroRNA polymorphisms: a giant leap towards personalized medicine / P. J. Misha // Per. Med. – 2009. – Vol. 6, N 2. – P. 119–125. DOI: 10.2217/17410541.6.2.119.
Most mammalian mRNAs are conserved targets of microRNAs / R. C. Friedman, K. K. Farh, C. B. Burge, D. P. Bartel // Genome Res. – 2009. – Vol. 19, N 1. – P. 92–105. doi: 10.1101/gr.082701.108. Epub 2008 Oct 27.
Mutation Altering the miR-184 Seed Region Causes Familial Keratoconus with Cataract / A. E. Hughes, D. T. Bradley, M. Campbell [et al.] // Am J Hum Genet. – 2011. – Vol. 89, N 5. – P. 628–633. doi: 10.1016/j.ajhg.2011.09.014.
Rajewsky N. microRNA target predictions in animals / N. Rajewsky // Nature Genetics. – 2006. – Vol. 38. – P. 8–13. doi: 10.1038/ng1798
RISC assembly defects in the Drosophila RNAi mutant armitage / Y. Tomari, T. Du, B. Haley [et al.] // Cell. – 2004. – Vol. 116, N 6. – P. 831–841.
Sayed D. MicroRNAs in development and disease / D. Sayed, M. Abdellatif // Physiol. Rev. – 2011. – Vol. 91, N 3. – P. 827–887. doi: 10.1152/physrev.00006.2010.
The impact of microRNAs on protein output / D. Baek, J. Villen, C. Shin [et al.] // Nature. – 2008. – Vol. 455 (7209). – P. 64–71. doi: 10.1038/nature07242.
The Microprocessor complex mediates the genesis of microRNAs / R. I. Gregory, K. P. Yan, G. Amuthan [et al.] // Nature. – 2004. – Vol. 432. – P. 235–240. doi: 10.1038/nature03120.
The bifunctional microRNA miR-9/miR-9* regulates REST and CoREST and is downregulated in Huntington’s dis ease / A. N. Packer, Y. Xing, S. Q. Harper [et al.] // J. Neurosci. – 2008. – Vol. 28, N 53. – P. 14341–14346. doi: 10.1523/JNEUROSCI.2390-08.2008.
The role of microRNA in nutritional control / E. N. Nolte-’t Hoen, E. Van Rooij, M. Bushell [et al.] // J. Intern. Med. – 2015. – Vol. 278, N 2. – P. 99–109. doi: 10.1111/joim.12372.
Thomson D. W. Experimental strategies for microRNA target identification / D. W. Thomson, C. P. Bracken, G. J. Goodall // Nucleic Acids Res. – 2011. – Vol. 39, N 16. – P. 6845–6853. doi: 10.1093/nar/gkr330. Epub 2011 Jun 7.
Variation in the miRNA-433 binding site of FGF20 confers risk for Parkinson disease by overex-pression of alpha-synuclein / G. Wang, J. M. van der Walt, G. Mayhew [et al.] // Am. J. Hum. Genet. – 2008. – Vol. 82, N 2. – P. 283–289. doi: 10.1016/j.ajhg.2007.09.021.
Weinberg M. S. Short non-coding RNA biology and neurodegenerative disorders: novel disease targets and therapeutics / M. S. Weinberg, M. J. Wood // Hum. Mol. Genet. – 2009. – Vol. 18, N R1. – P. R27–R39. doi: 10.1093/hmg/ddp070.
Widespread changes in protein synthesis induced by micro-RNAs / M. Selbach, B. Schwanhäusser, N. Thierfelder [et al.] // Nature. – 2008. – Vol. 455 (7209). – P. 58–63. doi: 10.1038/nature07228.
Wightman B. Posttranscriptional regulation of the heterochronic gene lin-14 by lin-4 mediates temporal pattern formation in C. elegans / B. Wightman, I. Ha, G. Ruvkun // Cell. – 1993. – Vol. 75, N 5. – P. 855–862.
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution 4.0 International License.
